Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpreP49446 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpreP49446 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpreP49446 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpreP49446 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpreP49446 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpreP49446 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpreP49446 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpreP49446 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpreP49446 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpreP49446 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpreP49446 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpreP49446 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtpreP49446 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpreP49446 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtpreP49446 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpreP49446 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtpreP49446 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtpreP49446 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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