Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epb42P49222 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epb42P49222 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb42P49222 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epb42P49222 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epb42P49222 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb42P49222 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb42P49222 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Epb42P49222 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms