Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbp3P49194 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbp3P49194 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbp3P49194 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms