Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1bP46735 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myo1bP46735 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo1bP46735 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms