Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sdc2P43407 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sdc2P43407 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdc2P43407 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms