Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlx1P43345 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlx1P43345 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlx1P43345 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlx1P43345 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlx1P43345 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlx1P43345 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx1P43345 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx1P43345 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx1P43345 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx1P43345 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx1P43345 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx1P43345 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx1P43345 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx1P43345 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx1P43345 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx1P43345 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx1P43345 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx1P43345 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx1P43345 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx1P43345 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx1P43345 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx1P43345 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx1P43345 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx1P43345 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms