Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gdf6P43028 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf6P43028 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf6P43028 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms