Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a2P43006 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a2P43006 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc1a2P43006 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms