Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Pik3caP42337 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3caP42337 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms