Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf2P39429 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf2P39429 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Traf2P39429 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Traf2P39429 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Traf2P39429 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf2P39429 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf2P39429 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf2P39429 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf2P39429 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf2P39429 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf2P39429 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf2P39429 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf2P39429 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf2P39429 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Traf2P39429 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf2P39429 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf2P39429 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf2P39429 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf2P39429 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf2P39429 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms