Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TtlP38585 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TtlP38585 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TtlP38585 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TtlP38585 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TtlP38585 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TtlP38585 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TtlP38585 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TtlP38585 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TtlP38585 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TtlP38585 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TtlP38585 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TtlP38585 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TtlP38585 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TtlP38585 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TtlP38585 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TtlP38585 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TtlP38585 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TtlP38585 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TtlP38585 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TtlP38585 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TtlP38585 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TtlP38585 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TtlP38585 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TtlP38585 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TtlP38585 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TtlP38585 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TtlP38585 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TtlP38585 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TtlP38585 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TtlP38585 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TtlP38585 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TtlP38585 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TtlP38585 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TtlP38585 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TtlP38585 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TtlP38585 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TtlP38585 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TtlP38585 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TtlP38585 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TtlP38585 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TtlP38585 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TtlP38585 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TtlP38585 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TtlP38585 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TtlP38585 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TtlP38585 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TtlP38585 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TtlP38585 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TtlP38585 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TtlP38585 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TtlP38585 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TtlP38585 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TtlP38585 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TtlP38585 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TtlP38585 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TtlP38585 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TtlP38585 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TtlP38585 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TtlP38585 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TtlP38585 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TtlP38585 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TtlP38585 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TtlP38585 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TtlP38585 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TtlP38585 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TtlP38585 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TtlP38585 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TtlP38585 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TtlP38585 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TtlP38585 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TtlP38585 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TtlP38585 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TtlP38585 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TtlP38585 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TtlP38585 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TtlP38585 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TtlP38585 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TtlP38585 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TtlP38585 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TtlP38585 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TtlP38585 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtlP38585 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtlP38585 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtlP38585 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtlP38585 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtlP38585 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtlP38585 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtlP38585 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TtlP38585 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtlP38585 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtlP38585 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TtlP38585 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TtlP38585 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TtlP38585 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TtlP38585 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TtlP38585 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TtlP38585 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TtlP38585 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TtlP38585 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms