Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig1P37913 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lig1P37913 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lig1P37913 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lig1P37913 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lig1P37913 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig1P37913 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lig1P37913 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lig1P37913 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig1P37913 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig1P37913 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig1P37913 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig1P37913 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig1P37913 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig1P37913 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lig1P37913 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lig1P37913 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms