Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddit3P35639 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddit3P35639 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms