Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OatP29758 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OatP29758 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OatP29758 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OatP29758 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OatP29758 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OatP29758 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OatP29758 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OatP29758 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OatP29758 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OatP29758 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OatP29758 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OatP29758 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OatP29758 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OatP29758 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OatP29758 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OatP29758 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OatP29758 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OatP29758 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OatP29758 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OatP29758 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OatP29758 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OatP29758 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OatP29758 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OatP29758 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OatP29758 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OatP29758 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OatP29758 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OatP29758 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OatP29758 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OatP29758 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OatP29758 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OatP29758 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OatP29758 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OatP29758 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OatP29758 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OatP29758 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OatP29758 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OatP29758 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OatP29758 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OatP29758 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OatP29758 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OatP29758 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OatP29758 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OatP29758 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OatP29758 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OatP29758 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OatP29758 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OatP29758 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OatP29758 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OatP29758 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OatP29758 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OatP29758 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OatP29758 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OatP29758 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OatP29758 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OatP29758 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OatP29758 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OatP29758 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OatP29758 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OatP29758 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OatP29758 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OatP29758 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OatP29758 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OatP29758 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OatP29758 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OatP29758 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OatP29758 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OatP29758 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OatP29758 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OatP29758 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OatP29758 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OatP29758 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OatP29758 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OatP29758 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OatP29758 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OatP29758 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OatP29758 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OatP29758 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OatP29758 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OatP29758 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OatP29758 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OatP29758 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OatP29758 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OatP29758 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OatP29758 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OatP29758 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OatP29758 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OatP29758 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OatP29758 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OatP29758 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OatP29758 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OatP29758 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OatP29758 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OatP29758 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OatP29758 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OatP29758 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
OatP29758 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OatP29758 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OatP29758 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms