Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp1P28563 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp1P28563 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms