Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col2a1P28481 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col2a1P28481 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col2a1P28481 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms