Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apex1P28352 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apex1P28352 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apex1P28352 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apex1P28352 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apex1P28352 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apex1P28352 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apex1P28352 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apex1P28352 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apex1P28352 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms