Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af2P26369 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af2P26369 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af2P26369 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af2P26369 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af2P26369 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af2P26369 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms