Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ggta1P23336 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ggta1P23336 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Ggta1P23336 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Ggta1P23336 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggta1P23336 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggta1P23336 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ggta1P23336 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggta1P23336 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggta1P23336 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggta1P23336 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggta1P23336 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggta1P23336 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggta1P23336 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggta1P23336 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ggta1P23336 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Ggta1P23336 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms