Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RarbP22605 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RarbP22605 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RarbP22605 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RarbP22605 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RarbP22605 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RarbP22605 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RarbP22605 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RarbP22605 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RarbP22605 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RarbP22605 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RarbP22605 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RarbP22605 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RarbP22605 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RarbP22605 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RarbP22605 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RarbP22605 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RarbP22605 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RarbP22605 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RarbP22605 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RarbP22605 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RarbP22605 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RarbP22605 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RarbP22605 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RarbP22605 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RarbP22605 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RarbP22605 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RarbP22605 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RarbP22605 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RarbP22605 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RarbP22605 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RarbP22605 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RarbP22605 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RarbP22605 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RarbP22605 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RarbP22605 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RarbP22605 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RarbP22605 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RarbP22605 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RarbP22605 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RarbP22605 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RarbP22605 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RarbP22605 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RarbP22605 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RarbP22605 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RarbP22605 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RarbP22605 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RarbP22605 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RarbP22605 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RarbP22605 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RarbP22605 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RarbP22605 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RarbP22605 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RarbP22605 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RarbP22605 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RarbP22605 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RarbP22605 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RarbP22605 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RarbP22605 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RarbP22605 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RarbP22605 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RarbP22605 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RarbP22605 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RarbP22605 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RarbP22605 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RarbP22605 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RarbP22605 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RarbP22605 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RarbP22605 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RarbP22605 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RarbP22605 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RarbP22605 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RarbP22605 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RarbP22605 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RarbP22605 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RarbP22605 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RarbP22605 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RarbP22605 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RarbP22605 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RarbP22605 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RarbP22605 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RarbP22605 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RarbP22605 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RarbP22605 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RarbP22605 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RarbP22605 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RarbP22605 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RarbP22605 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RarbP22605 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RarbP22605 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RarbP22605 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RarbP22605 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RarbP22605 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RarbP22605 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RarbP22605 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RarbP22605 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RarbP22605 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RarbP22605 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RarbP22605 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RarbP22605 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms