Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcaP20444 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms