Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd2P13011 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd2P13011 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scd2P13011 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scd2P13011 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd2P13011 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd2P13011 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scd2P13011 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scd2P13011 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scd2P13011 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms