Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsbP10605 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsbP10605 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsbP10605 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsbP10605 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsbP10605 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsbP10605 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsbP10605 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsbP10605 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsbP10605 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsbP10605 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsbP10605 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms