Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd8bP10300 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms