Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxb2P0C1T1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb2P0C1T1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb2P0C1T1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms