Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxb7P09024 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxb7P09024 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Hoxb7P09024 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxb7P09024 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxb7P09024 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxb7P09024 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms