Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NeflP08551 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NeflP08551 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NeflP08551 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NeflP08551 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NeflP08551 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NeflP08551 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NeflP08551 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NeflP08551 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NeflP08551 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NeflP08551 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NeflP08551 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NeflP08551 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NeflP08551 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NeflP08551 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NeflP08551 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NeflP08551 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NeflP08551 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NeflP08551 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NeflP08551 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NeflP08551 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NeflP08551 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NeflP08551 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NeflP08551 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NeflP08551 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NeflP08551 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NeflP08551 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NeflP08551 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NeflP08551 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NeflP08551 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NeflP08551 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NeflP08551 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NeflP08551 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NeflP08551 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NeflP08551 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NeflP08551 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NeflP08551 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NeflP08551 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NeflP08551 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NeflP08551 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NeflP08551 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NeflP08551 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NeflP08551 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NeflP08551 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NeflP08551 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NeflP08551 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NeflP08551 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NeflP08551 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NeflP08551 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NeflP08551 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NeflP08551 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NeflP08551 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NeflP08551 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NeflP08551 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NeflP08551 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NeflP08551 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NeflP08551 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NeflP08551 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NeflP08551 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NeflP08551 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NeflP08551 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NeflP08551 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NeflP08551 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NeflP08551 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NeflP08551 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NeflP08551 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NeflP08551 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NeflP08551 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NeflP08551 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NeflP08551 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NeflP08551 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NeflP08551 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NeflP08551 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NeflP08551 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NeflP08551 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NeflP08551 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NeflP08551 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NeflP08551 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NeflP08551 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NeflP08551 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NeflP08551 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NeflP08551 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NeflP08551 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NeflP08551 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NeflP08551 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NeflP08551 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NeflP08551 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NeflP08551 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NeflP08551 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NeflP08551 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NeflP08551 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NeflP08551 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NeflP08551 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NeflP08551 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NeflP08551 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NeflP08551 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NeflP08551 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NeflP08551 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NeflP08551 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NeflP08551 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms