Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P06323 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P06323 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P06323 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P06323 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P06323 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P06323 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P06323 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P06323 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P06323 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P06323 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P06323 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P06323 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P06323 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06323 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06323 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06323 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06323 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06323 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06323 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06323 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06323 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06323 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06323 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06323 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06323 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06323 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06323 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06323 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P06323 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06323 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06323 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06323 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06323 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P06323 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06323 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
P06323 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P06323 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06323 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06323 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06323 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06323 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06323 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06323 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06323 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06323 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P06323 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06323 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06323 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06323 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06323 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06323 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06323 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06323 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06323 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06323 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06323 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P06323 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06323 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06323 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06323 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06323 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06323 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06323 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06323 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06323 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06323 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06323 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06323 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06323 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06323 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06323 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P06323 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06323 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06323 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06323 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06323 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06323 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06323 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06323 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06323 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06323 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06323 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06323 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06323 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06323 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06323 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms