Protein–RNA interactions for Protein: P04756

Chrna1, Acetylcholine receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna1P04756 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chrna1P04756 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna1P04756 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms