Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01800 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01800 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01800 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01800 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01800 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01800 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01800 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01800 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01800 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01800 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01800 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01800 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01800 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01800 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01800 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01800 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01800 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01800 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01800 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01800 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01800 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01800 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01800 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01800 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01800 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01800 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01800 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01800 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01800 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01800 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01800 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01800 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01800 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01800 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01800 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01800 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01800 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01800 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01800 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01800 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01800 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01800 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01800 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01800 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01800 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01800 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01800 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01800 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01800 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01800 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01800 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01800 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01800 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01800 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01800 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01800 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01800 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01800 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01800 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01800 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01800 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01800 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01800 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01800 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01800 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms