Protein–RNA interactions for Protein: P01786

Ig heavy chain V region MOPC 47A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01786 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01786 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01786 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01786 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01786 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01786 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01786 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01786 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01786 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01786 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01786 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01786 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01786 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01786 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01786 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01786 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01786 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01786 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01786 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01786 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01786 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01786 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01786 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01786 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01786 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01786 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01786 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01786 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01786 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01786 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01786 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01786 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01786 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01786 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01786 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01786 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01786 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01786 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01786 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01786 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01786 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01786 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01786 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01786 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01786 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01786 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01786 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms