Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnb1P01575 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnb1P01575 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms