Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl20O89093 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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