Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc6O88978 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc6O88978 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc6O88978 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc6O88978 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc6O88978 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc6O88978 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc6O88978 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc6O88978 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc6O88978 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc6O88978 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc6O88978 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc6O88978 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc6O88978 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc6O88978 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms