Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba3O88888 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apba3O88888 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apba3O88888 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba3O88888 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba3O88888 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apba3O88888 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apba3O88888 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apba3O88888 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apba3O88888 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms