Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hcn2O88703 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hcn2O88703 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hcn2O88703 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hcn2O88703 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hcn2O88703 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hcn2O88703 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hcn2O88703 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hcn2O88703 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hcn2O88703 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hcn2O88703 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hcn2O88703 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hcn2O88703 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hcn2O88703 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hcn2O88703 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms