Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nid2O88322 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nid2O88322 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Nid2O88322 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nid2O88322 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nid2O88322 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nid2O88322 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Nid2O88322 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nid2O88322 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nid2O88322 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nid2O88322 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nid2O88322 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nid2O88322 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nid2O88322 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms