Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9aO70228 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9aO70228 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9aO70228 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9aO70228 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9aO70228 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp9aO70228 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp9aO70228 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp9aO70228 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp9aO70228 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp9aO70228 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp9aO70228 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms