Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atf5O70191 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf5O70191 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf5O70191 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf5O70191 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf5O70191 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Atf5O70191 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf5O70191 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf5O70191 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Atf5O70191 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atf5O70191 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf5O70191 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf5O70191 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf5O70191 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atf5O70191 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf5O70191 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf5O70191 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms