Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Bnip3O55003 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bnip3O55003 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bnip3O55003 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms