Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Csnk2a2O54833 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms