Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DffaO54786 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DffaO54786 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DffaO54786 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DffaO54786 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DffaO54786 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DffaO54786 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DffaO54786 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DffaO54786 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DffaO54786 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DffaO54786 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DffaO54786 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DffaO54786 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DffaO54786 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DffaO54786 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DffaO54786 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DffaO54786 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DffaO54786 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DffaO54786 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DffaO54786 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DffaO54786 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DffaO54786 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DffaO54786 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DffaO54786 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DffaO54786 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DffaO54786 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DffaO54786 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DffaO54786 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DffaO54786 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DffaO54786 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DffaO54786 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DffaO54786 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DffaO54786 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DffaO54786 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DffaO54786 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DffaO54786 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DffaO54786 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DffaO54786 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DffaO54786 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DffaO54786 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DffaO54786 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DffaO54786 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DffaO54786 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DffaO54786 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DffaO54786 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DffaO54786 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DffaO54786 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DffaO54786 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DffaO54786 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DffaO54786 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DffaO54786 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DffaO54786 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DffaO54786 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DffaO54786 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DffaO54786 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DffaO54786 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DffaO54786 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DffaO54786 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DffaO54786 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DffaO54786 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DffaO54786 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DffaO54786 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DffaO54786 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DffaO54786 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DffaO54786 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DffaO54786 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DffaO54786 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DffaO54786 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DffaO54786 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DffaO54786 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DffaO54786 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DffaO54786 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DffaO54786 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DffaO54786 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DffaO54786 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DffaO54786 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DffaO54786 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DffaO54786 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DffaO54786 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DffaO54786 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DffaO54786 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DffaO54786 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DffaO54786 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DffaO54786 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DffaO54786 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DffaO54786 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DffaO54786 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DffaO54786 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DffaO54786 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DffaO54786 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DffaO54786 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DffaO54786 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DffaO54786 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DffaO54786 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DffaO54786 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DffaO54786 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DffaO54786 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DffaO54786 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DffaO54786 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DffaO54786 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms