Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limk2O54785 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limk2O54785 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Limk2O54785 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Limk2O54785 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Limk2O54785 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Limk2O54785 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Limk2O54785 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Limk2O54785 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limk2O54785 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms