Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EdaO54693 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EdaO54693 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EdaO54693 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EdaO54693 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EdaO54693 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EdaO54693 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EdaO54693 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EdaO54693 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EdaO54693 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EdaO54693 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EdaO54693 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EdaO54693 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EdaO54693 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EdaO54693 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EdaO54693 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EdaO54693 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EdaO54693 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EdaO54693 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EdaO54693 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EdaO54693 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EdaO54693 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EdaO54693 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EdaO54693 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EdaO54693 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EdaO54693 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EdaO54693 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EdaO54693 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EdaO54693 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EdaO54693 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EdaO54693 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EdaO54693 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EdaO54693 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EdaO54693 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EdaO54693 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EdaO54693 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EdaO54693 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EdaO54693 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EdaO54693 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EdaO54693 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EdaO54693 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EdaO54693 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EdaO54693 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EdaO54693 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EdaO54693 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EdaO54693 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EdaO54693 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EdaO54693 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EdaO54693 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EdaO54693 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EdaO54693 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EdaO54693 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EdaO54693 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EdaO54693 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EdaO54693 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EdaO54693 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EdaO54693 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EdaO54693 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EdaO54693 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EdaO54693 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EdaO54693 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EdaO54693 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EdaO54693 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EdaO54693 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EdaO54693 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EdaO54693 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EdaO54693 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EdaO54693 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EdaO54693 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EdaO54693 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EdaO54693 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EdaO54693 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdaO54693 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdaO54693 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdaO54693 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdaO54693 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdaO54693 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EdaO54693 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EdaO54693 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EdaO54693 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EdaO54693 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EdaO54693 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EdaO54693 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EdaO54693 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EdaO54693 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EdaO54693 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdaO54693 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdaO54693 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdaO54693 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdaO54693 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdaO54693 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdaO54693 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdaO54693 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EdaO54693 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdaO54693 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EdaO54693 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EdaO54693 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EdaO54693 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EdaO54693 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EdaO54693 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms