Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd2O35927 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnd2O35927 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd2O35927 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms