Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp100O35892 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sp100O35892 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sp100O35892 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sp100O35892 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp100O35892 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp100O35892 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp100O35892 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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Sp100O35892 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp100O35892 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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