Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf18O35714 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnfrsf18O35714 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfrsf18O35714 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms