Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cldn4O35054 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn4O35054 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn4O35054 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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