Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casq1O09165 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casq1O09165 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casq1O09165 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq1O09165 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casq1O09165 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casq1O09165 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casq1O09165 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casq1O09165 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casq1O09165 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casq1O09165 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casq1O09165 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
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