Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ltbp2O08999 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltbp2O08999 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp2O08999 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.5 ms